Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PrkcbP68404 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrkcbP68404 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrkcbP68404 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms