Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms