Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snap25P60879 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms