Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Dpf3P58269 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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