Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PctpP53808 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PctpP53808 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PctpP53808 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PctpP53808 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms