Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rplp1P47955 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms