Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrprbP47758 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms