Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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