Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
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Rpl28P41105 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
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