Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RetP35546 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RetP35546 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RetP35546 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RetP35546 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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RetP35546 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RetP35546 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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