Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnd1P30999 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms