Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Znf239P24399 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Znf239P24399 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Znf239P24399 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf239P24399 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf239P24399 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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