Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sptan1P16546 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sptan1P16546 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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