Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CatspereP0DP43 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CatspereP0DP43 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms