Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Itgb1P09055 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Itgb1P09055 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms