Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tp53P02340 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tp53P02340 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tp53P02340 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms