Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vamp4O70480 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms