Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Copb2O55029 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms