Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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BckdkO55028 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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BckdkO55028 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
BckdkO55028 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BckdkO55028 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BckdkO55028 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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