Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lhx8O35652 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lhx8O35652 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms