Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih1O35372 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih1O35372 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih1O35372 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih1O35372 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih1O35372 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cnih1O35372 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Cnih1O35372 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cnih1O35372 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms