Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ArxO35085 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ArxO35085 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ArxO35085 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ArxO35085 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms