Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20878L7N244 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20878L7N244 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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