Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim18J3QNP2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Smim18J3QNP2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms