Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28038F7BCN9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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