Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 AC158238.1-201ENSMUST00000216899 1965 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm20538F6Z9R1 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms