Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm28305F6U473 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm28305F6U473 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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