Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
BC067074F6RXI4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
BC067074F6RXI4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms