Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm17175E9Q528 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm17175E9Q528 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms