Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms