Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph10bE9PYQ0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph10bE9PYQ0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms