Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3298E9PW80 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms