Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d4D3YUH6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms