Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm20547B8JJN0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm20547B8JJN0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20547B8JJN0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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