Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cspp1B2RX88 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms