Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prrt4B2RU40 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prrt4B2RU40 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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