Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brpf1B2RRD7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms