Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trabd2bB1ATG9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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