Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ambra1A2AH22 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms