Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap5A2AGT5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms