Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frmpd4A2AFR3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms