Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col9a3A2ACT7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms