Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8nlA2ABX0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms