Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef6A2A8M8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef6A2A8M8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef6A2A8M8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pramef6A2A8M8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pramef6A2A8M8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef6A2A8M8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pramef6A2A8M8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef6A2A8M8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pramef6A2A8M8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pramef6A2A8M8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef6A2A8M8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef6A2A8M8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef6A2A8M8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pramef6A2A8M8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pramef6A2A8M8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms