Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmg20bQ9Z104 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hmg20bQ9Z104 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hmg20bQ9Z104 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms