Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fam50bQ9WTJ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam50bQ9WTJ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50bQ9WTJ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50bQ9WTJ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms