Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VapbQ9QY76 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VapbQ9QY76 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VapbQ9QY76 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms