Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scamp4Q9JKV5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scamp4Q9JKV5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scamp4Q9JKV5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scamp4Q9JKV5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms