Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ercc6l2Q9JIM3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ercc6l2Q9JIM3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ercc6l2Q9JIM3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ercc6l2Q9JIM3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ercc6l2Q9JIM3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms