Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp29Q9ES63 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp29Q9ES63 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp29Q9ES63 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms